Доля Республики Беларусь в уставном фонде ОАО «Нафтан» составляет 99,83%. Органом, осуществляющим владельческий надзор, является Государственный комитет по имуществу Республики Беларусь.

Доля миноритарных акционеров в уставном фонде ОАО «Нафтан» составляет 0,17%.

В соответствии с решением годового общего собрания акционеров ОАО «Нафтан» (протокол от 30.03.2022 № 1):

• наблюдательный совет ОАО «Нафтан» сформирован в количестве 10 (десять) человек;
• ревизионная комиссия сформирована в количестве 7 (семь) человек.

Состав дирекции ОАО «Нафтан»:

• Генеральный директор ОАО «Нафтан»;
• Первый заместитель генерального директора – главный инженер ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора (по производству) ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора (по идеологической работе и социальному развитию) ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора (по химическому производству) – директор завода «Полимир» ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора (по экономике и финансам) ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора (по коммерческим вопросам) ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора – руководитель дирекции (по инвестиционным проектам, строительству и ремонту) ОАО «Нафтан»;
• Заместитель генерального директора (по материально-техническому обеспечению) ОАО «Нафтан».